解放军第309医院王芳等人，研究蛋白胨对臭氧水杀菌作用影响，论证了水中有机物对臭氧的消耗及降低了杀菌效果。

上海光辉臭氧开发研究所陈君胜在多年从事研究光电法产生臭氧的基础上，制造了光子臭氧发生器，并进行了“光子臭氧”对真菌杀灭和水体脱色的试验。

镇江康尔、江苏成城等企业，抓住我国制药行业GMP认证的机遇，开发了中央空调“内置式”、“外置式”臭氧发生器，对制药车间的空气进行杀菌处理，推动了臭氧在我国制药行业的应用。

2000年，上海华东理工大学魏兴义、刘勇弟等，为解决江苏某化工厂的废水，进行了臭氧化预处理提高代森锰锌废水的可生化性研究。2001年，魏兴义、鲁军、刘勇弟等，为上海某化工厂进行臭氧氧化法处理氰化亚铜废水的研究。

2001年，中科院化工冶金研究所吕雪松、王兆霖、李洪钟等人进行臭氧在超细碳黑表面改性中的应用研究，进行了在流化床中利用臭氧在不同条件下对碳黑进行了表面改性的实验，经臭氧处理的氧化碳黑的性质在许多方面都优于非氧化碳黑。

2001年，青岛亿海良种鱼培育中心、锦州达莲水产养殖有限公司研究臭氧对水产养殖用海水的处理及循环利用，分别采用了500g/h和200g/h的空气源臭氧发生器。2002年青岛蓝科生物技术公司与青岛中通臭氧科技公司合作，也进行了类似的试验研究。

2003年5月，山东泉林包装有限公司从事臭氧预吹处理对奶制品包装盒膜复合工艺效果的研究，经过半年多的小试和中试，于同年12月研制成功。2004年2月，富氧源1kg/h臭氧发生器在山东泉林包装有限公司投入生产使用，可保证臭氧浓度不变的情况下任意调整流量。这是我国首例臭氧应用于膜复合工艺的工程，为我国臭氧应用开辟了一个新的领域。

2003年，解放军总装备部工程设计总院张志仁采用臭氧对火箭推进剂废水净化处理的研究，并取得了突破性成果。2004年，解放军总装备部工程设计总院张统博士与青岛国林臭氧公司合作，应用臭氧处理含三硝基甲苯的炸药废水。

2003年五六月份，中国“非典”期间，北京工业大学病毒药理室主任李泽琳教授，在“BSL-3实验室”利用臭氧进行了灭活SARS病毒实验，对绿猴肾细胞接种的SARS病毒综合灭活率为99.22%，这是世界首例利用臭氧灭活SARS病毒的实验取得成功。随后，国家环保总局出台了《SARS病毒污染的污水应急处理技术方案》，臭氧是其推荐的消毒剂之一。

四川西普油脂化工有限公司朱进、杜俊超等人，开发臭氧氧化工艺制取高纯度乙醛酸，经过三年多的研究、小试、中试并取得成功，2004年8月开始采用臭氧氧化工艺工业化生产高纯度乙醛酸，技术达到国际先进水平，选用青岛国林臭氧公司的臭氧发生器。